MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii HLJ01 chromosome

Total Repeats: 23083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018887	TGAAA	2	10	94	103	60 %	20 %	20 %	0 %	410678749
2	NC_018887	T	6	6	112	117	0 %	100 %	0 %	0 %	410678749
3	NC_018887	TTA	3	9	125	133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678749
4	NC_018887	ATTT	2	8	144	151	25 %	75 %	0 %	0 %	410678749
5	NC_018887	AAAT	2	8	160	167	75 %	25 %	0 %	0 %	410678749
6	NC_018887	A	10	10	209	218	100 %	0 %	0 %	0 %	410678749
7	NC_018887	TA	3	6	245	250	50 %	50 %	0 %	0 %	410678749
8	NC_018887	AATG	2	8	314	321	50 %	25 %	25 %	0 %	410678749
9	NC_018887	CAA	2	6	363	368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678749
10	NC_018887	TTC	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678749
11	NC_018887	ACT	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678749
12	NC_018887	AAC	2	6	517	522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678749
13	NC_018887	TAA	2	6	586	591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678749
14	NC_018887	A	6	6	672	677	100 %	0 %	0 %	0 %	410678749
15	NC_018887	CTA	2	6	747	752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
16	NC_018887	ATA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678750
17	NC_018887	ATA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678750
18	NC_018887	AGC	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678750
19	NC_018887	AAAC	2	8	986	993	75 %	0 %	0 %	25 %	410678750
20	NC_018887	A	6	6	1015	1020	100 %	0 %	0 %	0 %	410678750
21	NC_018887	TCC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678750
22	NC_018887	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678750
23	NC_018887	T	7	7	1358	1364	0 %	100 %	0 %	0 %	410678750
24	NC_018887	CTA	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
25	NC_018887	ACT	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
26	NC_018887	CCTC	2	8	1390	1397	0 %	25 %	0 %	75 %	410678750
27	NC_018887	TCA	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
28	NC_018887	CAA	2	6	1409	1414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678750
29	NC_018887	T	7	7	1455	1461	0 %	100 %	0 %	0 %	410678750
30	NC_018887	TAAA	2	8	1490	1497	75 %	25 %	0 %	0 %	410678750
31	NC_018887	T	7	7	1517	1523	0 %	100 %	0 %	0 %	410678750
32	NC_018887	ATC	2	6	1536	1541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
33	NC_018887	ATT	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678750
34	NC_018887	TCA	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678750
35	NC_018887	AAAT	2	8	1719	1726	75 %	25 %	0 %	0 %	410678750
36	NC_018887	A	7	7	1733	1739	100 %	0 %	0 %	0 %	410678750
37	NC_018887	A	6	6	1741	1746	100 %	0 %	0 %	0 %	410678750
38	NC_018887	TAG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678751
39	NC_018887	ATT	2	6	1850	1855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
40	NC_018887	CTC	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
41	NC_018887	ATAC	2	8	1873	1880	50 %	25 %	0 %	25 %	410678751
42	NC_018887	ATAA	2	8	1917	1924	75 %	25 %	0 %	0 %	410678751
43	NC_018887	AT	3	6	2019	2024	50 %	50 %	0 %	0 %	410678751
44	NC_018887	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	410678751
45	NC_018887	TAT	2	6	2072	2077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
46	NC_018887	TCA	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678751
47	NC_018887	T	6	6	2088	2093	0 %	100 %	0 %	0 %	410678751
48	NC_018887	GAA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
49	NC_018887	TCC	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
50	NC_018887	CTC	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678751
51	NC_018887	AGA	2	6	2285	2290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
52	NC_018887	AATT	2	8	2326	2333	50 %	50 %	0 %	0 %	410678751
53	NC_018887	AT	4	8	2361	2368	50 %	50 %	0 %	0 %	410678751
54	NC_018887	AAAT	2	8	2397	2404	75 %	25 %	0 %	0 %	410678751
55	NC_018887	TGACCA	2	12	2427	2438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410678751
56	NC_018887	ATT	3	9	2459	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
57	NC_018887	TAT	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678751
58	NC_018887	ATC	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678751
59	NC_018887	T	6	6	2561	2566	0 %	100 %	0 %	0 %	410678751
60	NC_018887	AATCA	2	10	2591	2600	60 %	20 %	0 %	20 %	410678751
61	NC_018887	AAAT	2	8	2606	2613	75 %	25 %	0 %	0 %	410678751
62	NC_018887	AAAT	2	8	2629	2636	75 %	25 %	0 %	0 %	410678751
63	NC_018887	AT	3	6	2853	2858	50 %	50 %	0 %	0 %	410678751
64	NC_018887	TTTTTA	2	12	2874	2885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	410678751
65	NC_018887	GAAA	2	8	2930	2937	75 %	0 %	25 %	0 %	410678751
66	NC_018887	AAG	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678751
67	NC_018887	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	410678751
68	NC_018887	TAA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678751
69	NC_018887	CTT	2	6	3001	3006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678751
70	NC_018887	T	7	7	3041	3047	0 %	100 %	0 %	0 %	410678751
71	NC_018887	TTAAAC	2	12	3072	3083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410678751
72	NC_018887	T	6	6	3185	3190	0 %	100 %	0 %	0 %	410678751
73	NC_018887	A	6	6	3205	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	410678751
74	NC_018887	CATT	2	8	3226	3233	25 %	50 %	0 %	25 %	410678751
75	NC_018887	A	6	6	3411	3416	100 %	0 %	0 %	0 %	410678752
76	NC_018887	A	6	6	3473	3478	100 %	0 %	0 %	0 %	410678752
77	NC_018887	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
78	NC_018887	ATT	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678752
79	NC_018887	AATCC	2	10	3568	3577	40 %	20 %	0 %	40 %	410678752
80	NC_018887	GGATTA	2	12	3588	3599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
81	NC_018887	ATT	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678752
82	NC_018887	TAA	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
83	NC_018887	AGGTT	2	10	3667	3676	20 %	40 %	40 %	0 %	410678752
84	NC_018887	T	6	6	3675	3680	0 %	100 %	0 %	0 %	410678752
85	NC_018887	A	6	6	3716	3721	100 %	0 %	0 %	0 %	410678752
86	NC_018887	TGG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678752
87	NC_018887	ATA	2	6	3840	3845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
88	NC_018887	ATA	2	6	3859	3864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
89	NC_018887	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
90	NC_018887	TAAT	2	8	3892	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	410678752
91	NC_018887	TGA	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
92	NC_018887	ATA	2	6	3951	3956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
93	NC_018887	AAAGA	2	10	4061	4070	80 %	0 %	20 %	0 %	410678752
94	NC_018887	A	6	6	4076	4081	100 %	0 %	0 %	0 %	410678752
95	NC_018887	AAT	2	6	4091	4096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
96	NC_018887	AATG	2	8	4103	4110	50 %	25 %	25 %	0 %	410678752
97	NC_018887	TCAAT	2	10	4123	4132	40 %	40 %	0 %	20 %	410678752
98	NC_018887	TA	3	6	4174	4179	50 %	50 %	0 %	0 %	410678752
99	NC_018887	AATG	2	8	4233	4240	50 %	25 %	25 %	0 %	410678752
100	NC_018887	CTA	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678752
101	NC_018887	ATC	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678752
102	NC_018887	A	6	6	4375	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	410678752
103	NC_018887	TAA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678752
104	NC_018887	A	6	6	4433	4438	100 %	0 %	0 %	0 %	410678752
105	NC_018887	ATG	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
106	NC_018887	A	6	6	4483	4488	100 %	0 %	0 %	0 %	410678752
107	NC_018887	T	6	6	4496	4501	0 %	100 %	0 %	0 %	410678752
108	NC_018887	GAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678752
109	NC_018887	GATT	2	8	4576	4583	25 %	50 %	25 %	0 %	410678752
110	NC_018887	GGGA	2	8	4597	4604	25 %	0 %	75 %	0 %	410678752
111	NC_018887	ACT	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
112	NC_018887	ACA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678753
113	NC_018887	ATC	2	6	4795	4800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
114	NC_018887	A	6	6	4885	4890	100 %	0 %	0 %	0 %	410678753
115	NC_018887	TAA	2	6	4891	4896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
116	NC_018887	AGG	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678753
117	NC_018887	TAA	2	6	5011	5016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
118	NC_018887	TTG	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678753
119	NC_018887	TAA	2	6	5064	5069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
120	NC_018887	TTAT	2	8	5085	5092	25 %	75 %	0 %	0 %	410678753
121	NC_018887	CTA	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678753
122	NC_018887	TAA	2	6	5128	5133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
123	NC_018887	TAA	2	6	5139	5144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
124	NC_018887	A	6	6	5143	5148	100 %	0 %	0 %	0 %	410678753
125	NC_018887	ATA	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678753
126	NC_018887	T	6	6	5244	5249	0 %	100 %	0 %	0 %	410678754
127	NC_018887	T	8	8	5251	5258	0 %	100 %	0 %	0 %	410678754
128	NC_018887	ATTCC	2	10	5273	5282	20 %	40 %	0 %	40 %	410678754
129	NC_018887	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
130	NC_018887	CCTTG	2	10	5341	5350	0 %	40 %	20 %	40 %	410678754
131	NC_018887	TCA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678754
132	NC_018887	T	9	9	5386	5394	0 %	100 %	0 %	0 %	410678754
133	NC_018887	TCT	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
134	NC_018887	CTT	2	6	5491	5496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
135	NC_018887	CTT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678754
136	NC_018887	ATAA	2	8	5551	5558	75 %	25 %	0 %	0 %	410678754
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